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author | Adam Bard <github@adambard.com> | 2013-10-09 09:22:15 -0700 |
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committer | Adam Bard <github@adambard.com> | 2013-10-09 09:22:15 -0700 |
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Max. +# 135.0 310.0 425.0 591.2 680.0 3710.0 +stem(rivers) # 茎叶图(一种类似于直方图的展现形式) +# +# The decimal point is 2 digit(s) to the right of the | +# +# 0 | 4 +# 2 | 011223334555566667778888899900001111223333344455555666688888999 +# 4 | 111222333445566779001233344567 +# 6 | 000112233578012234468 +# 8 | 045790018 +# 10 | 04507 +# 12 | 1471 +# 14 | 56 +# 16 | 7 +# 18 | 9 +# 20 | +# 22 | 25 +# 24 | 3 +# 26 | +# 28 | +# 30 | +# 32 | +# 34 | +# 36 | 1 + + +stem(log(rivers)) # 查看数据集的方式既不是标准形式,也不是取log后的结果! 看起来,是钟形曲线形式的基本数据集 + +# The decimal point is 1 digit(s) to the left of the | +# +# 48 | 1 +# 50 | +# 52 | 15578 +# 54 | 44571222466689 +# 56 | 023334677000124455789 +# 58 | 00122366666999933445777 +# 60 | 122445567800133459 +# 62 | 112666799035 +# 64 | 00011334581257889 +# 66 | 003683579 +# 68 | 0019156 +# 70 | 079357 +# 72 | 89 +# 74 | 84 +# 76 | 56 +# 78 | 4 +# 80 | +# 82 | 2 + + +hist(rivers, col="#333333", border="white", breaks=25) # 试试用这些参数画画 (译者注:给 river 做统计频数直方图,包含了这些参数:数据源,颜色,边框,空格) +hist(log(rivers), col="#333333", border="white", breaks=25) #你还可以做更多式样的绘图 + +# 还有其他一些简单的数据集可以被用来加载。R 语言包括了大量这种 data() +data(discoveries) +plot(discoveries, col="#333333", lwd=3, xlab="Year", main="Number of important discoveries per year") +# 译者注:参数为(数据源,颜色,线条宽度,X 轴名称,标题) +plot(discoveries, col="#333333", lwd=3, type = "h", xlab="Year", main="Number of important discoveries per year") + + +# 除了按照默认的年份排序,我们还可以排序来发现特征 +sort(discoveries) +# [1] 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 +# [26] 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 3 3 +# [51] 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 4 4 4 4 4 4 4 4 +# [76] 4 4 4 4 5 5 5 5 5 5 5 6 6 6 6 6 6 7 7 7 7 8 9 10 12 + +stem(discoveries, scale=2) # 译者注:茎叶图(数据,放大系数) +# +# The decimal point is at the | +# +# 0 | 000000000 +# 1 | 000000000000 +# 2 | 00000000000000000000000000 +# 3 | 00000000000000000000 +# 4 | 000000000000 +# 5 | 0000000 +# 6 | 000000 +# 7 | 0000 +# 8 | 0 +# 9 | 0 +# 10 | 0 +# 11 | +# 12 | 0 + +max(discoveries) +# 12 + +summary(discoveries) +# Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max. +# 0.0 2.0 3.0 3.1 4.0 12.0 + + + + +#基本的统计学操作也不需要任何编程知识 + +#随机生成数据 +round(runif(7, min=.5, max=6.5)) +# 译者注:runif 产生随机数,round 四舍五入 +# 1 4 6 1 4 6 4 + +# 你输出的结果会和我们给出的不同,除非我们设置了相同的随机种子 random.seed(31337) + + +#从标准高斯函数中随机生成 9 次 +rnorm(9) +# [1] 0.07528471 1.03499859 1.34809556 -0.82356087 0.61638975 -1.88757271 +# [7] -0.59975593 0.57629164 1.08455362 + + + + + + + + + +######################### +# 基础编程 +######################### + +# 数值 + +#“数值”指的是双精度的浮点数 +5 # 5 +class(5) # "numeric" +5e4 # 50000 # 用科学技术法方便的处理极大值、极小值或者可变的量级 +6.02e23 # 阿伏伽德罗常数# +1.6e-35 # 布朗克长度 + +# 长整数并用 L 结尾 +5L # 5 +#输出5L +class(5L) # "integer" + +# 可以自己试一试?用 class() 函数获取更多信息 +# 事实上,你可以找一些文件查阅 `xyz` 以及xyz的差别 +# `xyz` 用来查看源码实现,?xyz 用来看帮助 + +# 算法 +10 + 66 # 76 +53.2 - 4 # 49.2 +2 * 2.0 # 4 +3L / 4 # 0.75 +3 %% 2 # 1 + +# 特殊数值类型 +class(NaN) # "numeric" +class(Inf) # "numeric" +class(-Inf) # "numeric" # 在以下场景中会用到 integrate( dnorm(x), 3, Inf ) -- 消除 Z 轴数据 + +# 但要注意,NaN 并不是唯一的特殊数值类型…… +class(NA) # 看上面 +class(NULL) # NULL + + +# 简单列表 +c(6, 8, 7, 5, 3, 0, 9) # 6 8 7 5 3 0 9 +c('alef', 'bet', 'gimmel', 'dalet', 'he') +c('Z', 'o', 'r', 'o') == "Zoro" # FALSE FALSE FALSE FALSE + +# 一些优雅的内置功能 +5:15 # 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 + +seq(from=0, to=31337, by=1337) +# [1] 0 1337 2674 4011 5348 6685 8022 9359 10696 12033 13370 14707 +# [13] 16044 17381 18718 20055 21392 22729 24066 25403 26740 28077 29414 30751 + +letters +# [1] "a" "b" "c" "d" "e" "f" "g" "h" "i" "j" "k" "l" "m" "n" "o" "p" "q" "r" "s" +# [20] "t" "u" "v" "w" "x" "y" "z" + +month.abb # "Jan" "Feb" "Mar" "Apr" "May" "Jun" "Jul" "Aug" "Sep" "Oct" "Nov" "Dec" + + +# Access the n'th element of a list with list.name[n] or sometimes list.name[[n]] +# 使用 list.name[n] 来访问第 n 个列表元素,有时候需要使用 list.name[[n]] +letters[18] # "r" +LETTERS[13] # "M" +month.name[9] # "September" +c(6, 8, 7, 5, 3, 0, 9)[3] # 7 + + + +# 字符串 + +# 字符串和字符在 R 语言中没有区别 +"Horatio" # "Horatio" +class("Horatio") # "character" +substr("Fortuna multis dat nimis, nulli satis.", 9, 15) # "multis " +gsub('u', 'ø', "Fortuna multis dat nimis, nulli satis.") # "Fortøna møltis dat nimis, nølli satis." + + + +# 逻辑值 + +# 布尔值 +class(TRUE) # "logical" +class(FALSE) # "logical" +# 和我们预想的一样 +TRUE == TRUE # TRUE +TRUE == FALSE # FALSE +FALSE != FALSE # FALSE +FALSE != TRUE # TRUE +# 缺失数据(NA)也是逻辑值 +class(NA) # "logical" +#定义NA为逻辑型 + + + +# 因子 +# 因子是为数据分类排序设计的(像是排序小朋友们的年级或性别) +levels(factor(c("female", "male", "male", "female", "NA", "female"))) # "female" "male" "NA" + +factor(c("female", "female", "male", "NA", "female")) +# female female male NA female +# Levels: female male NA + +data(infert) # 自然以及引产导致的不育症 +levels(infert$education) # "0-5yrs" "6-11yrs" "12+ yrs" + + + +# 变量 + +# 有许多种方式用来赋值 +x = 5 # 这样可以 +y <- "1" # 更推荐这样 +TRUE -> z # 这样可行,但是很怪 + +#我们还可以使用强制转型 +as.numeric(y) # 1 +as.character(x) # "5" + +# 循环 + +# for 循环语句 +for (i in 1:4) { + print(i) +} + +# while 循环 +a <- 10 +while (a > 4) { + cat(a, "...", sep = "") + a <- a - 1 +} + +# 记住,在 R 语言中 for / while 循环都很慢 +# 建议使用 apply()(我们一会介绍)来错做一串数据(比如一列或者一行数据) + +# IF/ELSE + +# 再来看这些优雅的标准 +if (4 > 3) { + print("Huzzah! It worked!") +} else { + print("Noooo! This is blatantly illogical!") +} + +# => +# [1] "Huzzah! It worked!" + +# 函数 + +# 定义如下 +jiggle <- function(x) { + x + rnorm(x, sd=.1) #add in a bit of (controlled) noise + return(x) +} + +# 和其他 R 语言函数一样调用 +jiggle(5) # 5±ε. 使用 set.seed(2716057) 后, jiggle(5)==5.005043 + +######################### +# 数据容器:vectors, matrices, data frames, and arrays +######################### + +# 单维度 +# 你可以将目前我们学习到的任何类型矢量化,只要它们拥有相同的类型 +vec <- c(8, 9, 10, 11) +vec # 8 9 10 11 +# 矢量的类型是这一组数据元素的类型 +class(vec) # "numeric" +# If you vectorize items of different classes, weird coercions happen +#如果你强制的将不同类型数值矢量化,会出现特殊值 +c(TRUE, 4) # 1 4 +c("dog", TRUE, 4) # "dog" "TRUE" "4" + +#我们这样来取内部数据,(R 的下标索引顺序 1 开始) +vec[1] # 8 +# 我们可以根据条件查找特定数据 +which(vec %% 2 == 0) # 1 3 +# 抓取矢量中第一个和最后一个字符 +head(vec, 1) # 8 +tail(vec, 1) # 11 +#如果下标溢出或不存会得到 NA +vec[6] # NA +# 你可以使用 length() 获取矢量的长度 +length(vec) # 4 + +# 你可以直接操作矢量或者矢量的子集 +vec * 4 # 16 20 24 28 +vec[2:3] * 5 # 25 30 +# 这里有许多内置的函数,来表现向量 +mean(vec) # 9.5 +var(vec) # 1.666667 +sd(vec) # 1.290994 +max(vec) # 11 +min(vec) # 8 +sum(vec) # 38 + +# 二维(相同元素类型) + +#你可以为同样类型的变量建立矩阵 +mat <- matrix(nrow = 3, ncol = 2, c(1,2,3,4,5,6)) +mat +# => +# [,1] [,2] +# [1,] 1 4 +# [2,] 2 5 +# [3,] 3 6 +# 和 vector 不一样的是,一个矩阵的类型真的是 「matrix」,而不是内部元素的类型 +class(mat) # => "matrix" +# 访问第一行的字符 +mat[1,] # 1 4 +# 操作第一行数据 +3 * mat[,1] # 3 6 9 +# 访问一个特定数据 +mat[3,2] # 6 +# 转置整个矩阵(译者注:变成 2 行 3 列) +t(mat) +# => +# [,1] [,2] [,3] +# [1,] 1 2 3 +# [2,] 4 5 6 + +# 使用 cbind() 函数把两个矩阵按列合并,形成新的矩阵 +mat2 <- cbind(1:4, c("dog", "cat", "bird", "dog")) +mat2 +# => +# [,1] [,2] +# [1,] "1" "dog" +# [2,] "2" "cat" +# [3,] "3" "bird" +# [4,] "4" "dog" +class(mat2) # matrix +# Again, note what happened! +# 注意 +# 因为矩阵内部元素必须包含同样的类型 +# 所以现在每一个元素都转化成字符串 +c(class(mat2[,1]), class(mat2[,2])) + +# 按行合并两个向量,建立新的矩阵 +mat3 <- rbind(c(1,2,4,5), c(6,7,0,4)) +mat3 +# => +# [,1] [,2] [,3] [,4] +# [1,] 1 2 4 5 +# [2,] 6 7 0 4 +# 哈哈,数据类型都一样的,没有发生强制转换,生活真美好 + +# 二维(不同的元素类型) + +# 利用 data frame 可以将不同类型数据放在一起 +dat <- data.frame(c(5,2,1,4), c("dog", "cat", "bird", "dog")) +names(dat) <- c("number", "species") # 给数据列命名 +class(dat) # "data.frame" +dat +# => +# number species +# 1 5 dog +# 2 2 cat +# 3 1 bird +# 4 4 dog +class(dat$number) # "numeric" +class(dat[,2]) # "factor" +# data.frame() 会将字符向量转换为 factor 向量 + +# 有很多精妙的方法来获取 data frame 的子数据集 +dat$number # 5 2 1 4 +dat[,1] # 5 2 1 4 +dat[,"number"] # 5 2 1 4 + +# 多维(相同元素类型) + +# 使用 arry 创造一个 n 维的表格 +# You can make a two-dimensional table (sort of like a matrix) +# 你可以建立一个 2 维表格(有点像矩阵) +array(c(c(1,2,4,5),c(8,9,3,6)), dim=c(2,4)) +# => +# [,1] [,2] [,3] [,4] +# [1,] 1 4 8 3 +# [2,] 2 5 9 6 +#你也可以利用数组建立一个三维的矩阵 +array(c(c(c(2,300,4),c(8,9,0)),c(c(5,60,0),c(66,7,847))), dim=c(3,2,2)) +# => +# , , 1 +# +# [,1] [,2] +# [1,] 2 8 +# [2,] 300 9 +# [3,] 4 0 +# +# , , 2 +# +# [,1] [,2] +# [1,] 5 66 +# [2,] 60 7 +# [3,] 0 847 + +#列表(多维的,不同类型的) + +# R语言有列表的形式 +list1 <- list(time = 1:40) +list1$price = c(rnorm(40,.5*list1$time,4)) # 随机 +list1 + +# You can get items in the list like so +# 你可以这样获得列表的元素 +list1$time +# You can subset list items like vectors +# 你也可以和矢量一样获取他们的子集 +list1$price[4] + +######################### +# apply()函数家族 +######################### + +# 还记得 mat 么? +mat +# => +# [,1] [,2] +# [1,] 1 4 +# [2,] 2 5 +# [3,] 3 6 +# Use apply(X, MARGIN, FUN) to apply function FUN to a matrix X +# 使用(X, MARGIN, FUN)将函数 FUN 应用到矩阵 X 的行 (MAR = 1) 或者 列 (MAR = 2) +# That is, R does FUN to each row (or column) of X, much faster than a +# R 在 X 的每一行/列使用 FUN,比循环要快很多 +apply(mat, MAR = 2, myFunc) +# => +# [,1] [,2] +# [1,] 3 15 +# [2,] 7 19 +# [3,] 11 23 +# 还有其他家族函数 ?lapply, ?sapply + +# 不要被吓到,虽然许多人在此都被搞混 +# plyr 程序包的作用是用来改进 apply() 函数家族 + +install.packages("plyr") +require(plyr) +?plyr + +######################### +# 载入数据 +######################### + +# "pets.csv" 是网上的一个文本 +pets <- read.csv("http://learnxinyminutes.com/docs/pets.csv") +pets +head(pets, 2) # 前两行 +tail(pets, 1) # 最后一行 + +# 以 .csv 格式来保存数据集或者矩阵 +write.csv(pets, "pets2.csv") # 保存到新的文件 pets2.csv +# set working directory with setwd(), look it up with getwd() +# 使用 setwd() 改变工作目录,使用 getwd() 查看当前工作目录 + +# 尝试使用 ?read.csv 和 ?write.csv 来查看更多信息 + +######################### +# 画图 +######################### + +# 散点图 +plot(list1$time, list1$price, main = "fake data") # 译者注:横轴 list1$time,纵轴 wlist1$price,标题 fake data +# 回归图 +linearModel <- lm(price ~ time, data = list1) # 译者注:线性模型,数据集为list1,以价格对时间做相关分析模型 +linearModel # 拟合结果 +# 将拟合结果展示在图上,颜色设为红色 +abline(linearModel, col = "red") +# 也可以获取各种各样漂亮的分析图 +plot(linearModel) + +# 直方图 +hist(rpois(n = 10000, lambda = 5), col = "thistle") # 译者注:统计频数直方图 + +# 柱状图 +barplot(c(1,4,5,1,2), names.arg = c("red","blue","purple","green","yellow")) + +# 可以尝试着使用 ggplot2 程序包来美化图片 +install.packages("ggplot2") +require(ggplot2) +?ggplot2 + +``` + +## 获得 R + +* 从 [http://www.r-project.org/](http://www.r-project.org/) 获得安装包和图形化界面 +* [RStudio](http://www.rstudio.com/ide/) 是另一个图形化界面 |